Caracterización molecular de Escherichia coli bacteriémicos pertenecientes a los serogrupos O1 e O2

Abstract

[ESP] En los últimos años se ha observado un aumento de bacteriemias causadas por E. coli patógenos extraintestinales (ExPEC), E. coli uropatogénicos (UPEC) y E. coli patógenos aviares (APEC). Entre los serogrupos más prevalentes a nivel global se encuentran los serogrupos O1 y O2. Nuestro objetivo es caracterizar las cepas pertenecientes a estos serogrupos, buscando entender las razones de su éxito. Determinar las características de estas cepas es vital para diseñar vacunas adaptadas a la epidemiología actual de nuestra área sanitaria. Para el estudio y caracterización de las 53 cepas de E. coli causantes de bacteriemias en un hospital lucense (HULA) durante los años 2020 a 2022 utilizamos métodos fenotípicos (serotipado, determinación de CMIs) y moleculares. Determinamos serotipos, grupos filogenéticos y genes de virulencia para establecer los estatus ExPEC, UPEC y APEC. La colección incluye 20 cepas O1, 33 O2, de las cuales solo 6 resultaron ser multirresistentes (MDR). La caracterización molecular muestra que el grupo filogenético más abundante es el B2 (42 cepas). Las cepas del presente estudio mostraron una amplia colección de factores de virulencia. En base a sus genes de virulencia, 46 cepas se calificaron como ExPEC, 48 UPEC y 31 APEC. Además, se detectaron 24 aislados pertenecientes a la secuencia tipo 95. Los resultados confirman que un porcentaje significativo de cepas causantes de septicemias en la población lucense son positivas para ExPEC, UPEC y APEC. Asimismo, se reafirma la idea de que el éxito de los serogrupos O1 y O2 no se debe a su resistencia a los antibióticos si no al elevado número de factores de virulencia.[GAL] Nos últimos anos observouse un aumento de bacteriemias causadas por E. coli patóxenos extraintestinales (ExPEC), E. coli uropatoxénicos (UPEC) e E. coli patóxenos aviarios (APEC). Entre os serogrupos máis prevalecentes a nivel global atópanse os serogrupos O1 e O2. O noso obxectivo é caracterizar as cepas pertencentes a estes serogrupos, buscando entender as razóns do seu éxito. Determinar as características destas cepas é vital para deseñar vacinas adaptadas á epidemioloxía actual da nosa área sanitaria. Para o estudo e caracterización das 53 cepas de E. coli causantes de bacteriemias nun hospital lucense (HULA) durante os anos 2020 a 2022 utilizamos métodos fenotípicos (serotipado, determinación de CMIs) e moleculares. Determinamos serotipos, grupos filogenéticos e xenes de virulencia para establecer os status ExPEC, UPEC e APEC. A colección inclúe 20 cepas O1, 33 O2, das cales só 6 resultaron ser multirresistentes (MDR). A caracterización molecular mostra que o grupo filogenético máis abundante é o B2 (42 cepas). As cepas do presente estudo mostraron unha ampla colección de factores de virulencia. En base aos seus xenes de virulencia, 46 cepas cualificáronse como ExPEC, 48 UPEC e 31 APEC. Ademais, detectáronse 24 illados pertencentes á secuencia tipo 95. Os resultados confirman que unha porcentaxe significativa de cepas causantes de septicemias na poboación lucense son positivas para ExPEC, UPEC e APEC. Así mesmo, reafírmase a idea de que o éxito dos serogrupos O1 e O2 non se debe á súa resistencia aos antibióticos se non ao elevado número de factores de virulencia.[ENG] Recent years have seen an increase in bacteraemias caused by extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC), uropathogenic E. coli (UPEC) and avian pathogenic E. coli (APEC). Among the most prevalent serogroups globally are serogroups O1 and O2. Our objective is to characterise strains belonging to these serogroups, seeking to understand the reasons for their success. Determining the characteristics of these strains is vital to design vaccines adapted to the current epidemiology of our health area. For the study and characterisation of the 53 E. coli strains causing bacteraemia in a hospital in Lugo (HULA) during the years 2020 to 2022, we used phenotypic (serotyping, determination of MICs) and molecular methods. We determine serotypes, phylogenetic groups and virulence genes to establish ExPEC, UPEC and APEC status. The collection includes 20 O1, 33 O2 strains, of which only 6 were found to be multidrug resistant (MDR). Molecular characterisation shows that the most abundant phylogenetic group is B2 (42 strains). The strains in the present study showed a broad collection of virulence factors. Based on their virulence genes, 46 strains were qualified as ExPEC, 48 UPEC and 31 APEC. In addition, 24 isolates belonging to sequence type 95 were detected. The results confirm that a significant percentage of strains causing septicaemia in the population of Lugo are positive for ExPEC, UPEC and APEC. Likewise, it reaffirms the idea that the success of serogroups O1 and O2 is not due to their resistance to antibiotics but to the high number of virulence factors.