Evaluación de la firma bacteriana en muestras de ADN fecal como herramienta complementaria para la detección temprana del cáncer colorrectal

Abstract

[ESP] El cáncer colorrectal (CCR) es una de las principales causas de morbilidad y mortalidad a nivel mundial, subrayando la importancia de la detección temprana para mejorar las tasas de supervivencia de los pacientes. En este contexto, se llevó a cabo un proyecto de investigación utilizando el análisis RAID-CRC Screen, una técnica innovadora que combina la extracción de ADN fecal con el análisis de la firma bacteriana mediante qPCR (reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real). El objetivo principal de esta investigación fue evaluar si la incorporación del análisis RAID-CRC Screen (qPCR de ADN fecal para la firma bacteriana) podría mejorar las características del Test Inmunohistoquímico Fecal (FIT), reduciendo potencialmente la necesidad de realizar pruebas invasivas. La hipótesis central planteaba que las alteraciones en la firma bacteriana fecal podrían diferenciar entre casos verdaderamente positivos de CRC y falsos positivos inducidos por otros factores, como hemorragias gastrointestinales menores. Para lograr este objetivo, se obtuvieron muestras de pacientes que consintieron participar en el estudio, seguidas de la extracción de ADN fecal y el análisis de la firma bacteriana mediante qPCR. Esto permitió identificar posibles desequilibrios en la microbiota intestinal asociados con el CCR. Los resultados obtenidos concluyeron que el análisis de la microbiota mejora la sensibilidad, pero sin aportar una mejora significativa sobre la prueba FIT. Además, solo se encontró una diferencia significativa entre los diagnósticos entre los cinco grupos de bacterias estudiadas, lo que sugiere la necesidad de modificar las especies de bacterias analizados para mejorar la prueba.

[GAL] O cancro colorrectal (CCR) é unha das principais causas de morbilidade e mortalidade a nivel mundial, subliñando a importancia da detección temperá para mellorar as taxas de supervivencia dos pacientes. Neste contexto, levouse a cabo un proxecto de investigación utilizando a análise RAID-CRC Screen, unha técnica innovadora que combina a extracción de ADN fecal coa análise da firma bacteriana mediante qPCR (reacción en cadea da polimerasa cuantitativa en tempo real). O obxectivo principal desta investigación foi avaliar se a incorporación da análise RAID-CRC Screen (qPCR de ADN fecal para a firma bacteriana) podería mellorar as características do Test Inmunohistoquímico Fecal (FIT), reducindo potencialmente a necesidade de realizar probas invasivas. A hipótese central plantexaba que as alteracións na firma bacteriana fecal poderían diferenciar entre casos verdadeiramente positivos de CCR e falsos positivos inducidos por outros factores, como hemorraxias gastrointestinais menores. Para acadar este obxectivo, obtivéronse mostras de pacientes que consentiron participar no estudo, seguidas da extracción de ADN fecal e do análise da firma bacteriana mediante qPCR. Isto permitiu identificar posibles desequilibrios na microbiota intestinal asociados co CCR. Os resultados obtidos concluíron que a análise da microbiota mellora a sensibilidade, máis non aporta unha mellora significativa sobre a proba FIT. Ademais, só se atopou unha diferenza significativa nas diagnoses dos cinco grupos de bacterias estudadas, o que suxire a necesidade de modificar as bacterias analizadas para mellorar a proba.

[ENG] Colorectal cancer (CRC) is one of the leading causes of morbidity and mortality worldwide, highlighting the importance of early detection to improve patient survival rates. In this context, a research project was conducted using RAID-CRC Screen analysis, an innovative technique that combines fecal DNA extraction with bacterial signature analysis via quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR). The main objective of this research was to evaluate whether the incorporation of RAID-CRC Screen analysis (fecal DNA qPCR for bacterial signature) could enhance the performance of the Fecal Immunochemical Test (FIT), potentially reducing the need for invasive tests. The central hypothesis posited that alterations in the fecal bacterial signature could distinguish between true positive CRC cases and false positives induced by other factors, such as minor gastrointestinal bleeding. To achieve this objective, samples were obtained from patients who consented to participate in the study. These samples underwent, fecal DNA extraction and bacterial signature analysis via qPCR. This allowed for the identification of possible imbalances in the gut microbiota associated with CRC. The results concluded that microbiota analysis improves sensitivity but does not provide a significant improvement over the FIT. Additionally, a significant difference in diagnoses was found in only one of the five bacterial groups studied, suggesting the need to modify the bacteria groups analyzed to improve the test.