Caracterización proteómica del epitelio oral de pacientes con enfermedad liquenoide oral con o sin displasia frente a la displasia epitelial canónica

Abstract

El liquen plano oral (LPO) afecta a aproximadamente al 1% de la población mundial y se considera un trastorno oral potencialmente maligno (TOPM). Sin embargo, cuando se valoran los criterios histopatológicos se denota una controversia entre los investigadores, especialmente en relación a la presencia de displasia epitelial como criterio diagnóstico de exclusión para el LPO. Muchos patólogos consideran actualmente la presencia de displasia epitelial como un criterio de exclusión. En este estudio, se examinaron los perfiles moleculares de la displasia epitelial oral con características liquenoides (OLD), LPO y DEO para determinar si OLD representa una entidad separada. Se utilizaron muestras parafinadas para el análisis proteómico con LC-MS/MS y posteriormente el SWATH-MS para la identificación y cuantificación de proteínas. Se analizaron y perfilaron los proteomas de tejido de los tres grupos. Se identificaron un total de 366 proteínas. Se realizaron tres comparaciones: DEO frente LPO, OLD frente DEO y DEO frente OLD. El análisis de expresión diferencial reveló siete proteínas con diferencias significativas (p<0.05) en DEO en comparación con LPO. En la segunda comparación se identificaron 15 proteínas, y en la tercera se identificaron 12 proteínas. Los resultados del análisis proteómico revelaron que OLD no es una entidad patológica distinta, aunque se asemeja mucho a DEO. Sin embargo, se destacó que la displasia epitelial no debe considerarse un criterio de exclusión para el LPO desde una perspectiva proteómica. Además, se observó una alta expresión de genes relacionados con funciones biológicas en OLD y DEO, y baja expresión en LPO. El enriquecimiento funcional reveló vías y ontologías significativas relacionadas con la señalización inflamatoria y la respuesta inmunológica en todos los subgrupos. En conclusión, los datos proteómicos obtenidos en este estudio indican que OLD no representa una entidad patológica independiente, aunque se encuentra estrechamente relacionada con DEO. Asimismo, se resalta la importancia de reconsiderar la presencia de displasia epitelial como criterio de exclusión para el diagnóstico de LPO desde una perspectiva proteómica

O liquen plano oral (LPO) afecta aproximadamente ao 1% da poboación mundial e agora considérase un trastorno oral potencialmente maligno (TOPM). Con todo, cando se valoran os criterios histopatolóxicos denótase unha controversia entre os investigadores, especialmente en relación coa presenza de displasia epitelial como criterio diagnóstico de exclusión para o LPO. Moitos patólogos consideran actualmente a presenza de displasia epitelial como un criterio de exclusión. Neste estudo, examináronse os perfís moleculares da displasia epitelial oral con características liquenoides (OLD), LPO e DEO para determinar se OLD representa unha entidade separada. Utilizáronse mostras parafinadas para o análisis proteómico con LC-MS/MS e posteriormente co SWATH-MS para a identificación e cuantificación de proteínas. Analizáronse e perfiláronse os proteomas de tecido dos tres grupos. Identificáronse un total de 366 proteínas. Realizaronse tres comparacións: DEO fronte a LPO, OLD fronte a DEO e DEO fronte a OLD. A análise de expresión diferencial revelou sete proteínas con diferenzas significativas (p<0.05) en DEO en comparación con LPO. Na segunda comparación identificáronse 15 proteínas e na terceira identificáronse 12 proteínas. Os resultados da análise proteómica revelaron que OLD non é unha entidade patolóxica distinta, aínda que se asemella moito a DEO. Con todo, sinalouse que a displasia epitelial non debe considerarse un criterio de exclusión para o LPO desde unha perspectiva proteómica. Ademais, observouse unha alta expresión de xenes relacionados con funcións biolóxicas en OLD e DEO e baixa expresión en LPO. O enriquecemento funcional revelou vias e ontoloxías significativas relacionadas coa sinalización inflamatoria e a resposta inmunolóxica en todos os subgrupos. En conclusión, os datos proteómicos obtidos neste estudo indican que OLD non representa unha entidade patolóxica independente, aínda que está estreitamente relacionada con DEO. Resáltase tamén a importancia de reconsiderar a presenza de displasia epitelial como criterio de exclusión para o diagnóstico de LPO desde unha perspectiva proteómica

The oral lichen planus (OLP) affects approximately 1% of the world's population and is considered a potentially malignant oral disorder (PMOD). However, there is controversy among researchers, particularly regarding the presence of epithelial dysplasia as a diagnostic criterion for exclusion in OLP. Many pathologists currently consider the presence of epithelial dysplasia as an exclusion criterion. In this study, we examined the molecular profiles of Oral Epithelial Dysplasia with Lichenoid Features (OLD), OLP, and OED to determine if OLD represents a separate entity. Paraffin-embedded samples were used for proteomic analysis with LC-MS/MS, and subsequently SWATH-MS was employed for protein identification and quantification. The tissue proteomes of the three groups were analyzed and profiled. A total of 366 proteins were identified. Three comparisons were conducted: OED versus OLP, OLD versus OED, and OED versus OLD. Differential expression analysis revealed seven proteins with significant differences (p<0.05) in OED compared to OLP. Fifteen proteins were identified in the second comparison, and twelve proteins in the third comparison. The results of the proteomic analysis revealed that OLD is not a distinct pathological entity, although it closely resembles OED. However, it was highlighted that epithelial dysplasia should not be considered an exclusion criterion for OLP from a proteomic perspective. Additionally, a high expression of genes related to biological functions was observed in OLD and OED, while low expression was observed in OLP. Functional enrichment analysis revealed significant pathways and ontologies related to inflammatory signaling and immune response in all subgroups. In conclusion, the proteomic data obtained in this study indicates that OLD does not represent an independent pathological entity, although it is closely related to OED. Furthermore, the importance of reconsidering the presence of epithelial dysplasia as an exclusion criterion for the diagnosis of OLP from a proteomic perspective is emphasized